Puerto Aysén é uma cidade localizada na Região de Aysén de General Carlos Ibáñez del Campo, no Chile.
Fundada em 1929, seu nome se deve ao rio Aysén, que a atravessa e desemboca no Oceano Pacífico.
Originalmente, a economia da cidade era baseada na pesca e na extração de madeira, mas atualmente também se destaca pelo turismo e pela agricultura.
Durante a ditadura militar de Augusto Pinochet, Puerto Aysén foi palco de inúmeras violações de direitos humanos e repressão política.
Atualmente, Puerto Aysén é um importante centro urbano e turístico da Região de Aysén, com atrações como o Parque Nacional Queulat, o fiorde de Aysén e a Rota Cênica Austral.
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